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Functional site prediction of BRCT domain containing phosphate binding pocket

SHENG Zi-Zhang HUANG Jing-Fei

SHENG Zi-Zhang, HUANG Jing-Fei. Functional site prediction of BRCT domain containing phosphate binding pocket. Zoological Research, 2011, 32(5): 509-514. doi: 10.3724/SP.J.1141.2011.05509
Citation: SHENG Zi-Zhang, HUANG Jing-Fei. Functional site prediction of BRCT domain containing phosphate binding pocket. Zoological Research, 2011, 32(5): 509-514. doi: 10.3724/SP.J.1141.2011.05509

含磷酸结合口袋的BRCT结构域功能位点预测

doi: 10.3724/SP.J.1141.2011.05509
基金项目: 国家重点基础研究发展计划项目“973”(2009CB941302); 国家自然科学基金项目(30470939、30623007); 中国科学院基金项目(2007211311091)
详细信息
    作者简介:

    盛自章

    通讯作者:

    黄京飞

  • 中图分类号: Q5-3; Q811.4; TP399; R711.75

Functional site prediction of BRCT domain containing phosphate binding pocket

More Information
    Author Bio:

    SHENG Zi-Zhang

    Corresponding author: HUANG Jing-Fei
  • 摘要: BRCT( BRCA1 C-terminus)是真核生物DNA损伤修复系统重要的信号传导和蛋白靶向结构域。为了探讨含磷酸结合口袋的BRCT与磷酸化配体结合的机制, 对XRCC1 BRCT1、PTIP BRCT4、ECT2 BRCT1和 TopBP1 BRCT1进行了结构保守性和表面静电势分析。结果显示, 4个BRCT的磷酸结合口袋周围所存在的结构保守并带正电势的沟槽很可能是其功能位点, 并且类似的沟槽在含磷酸结合口袋的BRCT中普遍存在。沟槽两侧及底部均带有极性氨基酸残基, 两侧带正电荷, 而底部疏水。这说明沟槽与配体的结合以静电和疏水相互作用为主。沟槽主要位于单个BRCT中,而且4个BRCT的沟槽在形状和电荷分布上都不同, 说确明BRCT配体特异性主要由单个BRCT决定。磷酸结合口袋位于沟槽中心, 说明沟槽可能同时结合磷酸化残基的N端和C端附近残基。
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出版历程
  • 收稿日期:  2011-04-11
  • 修回日期:  2011-07-01
  • 刊出日期:  2011-10-22

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