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Heteroplasmy in mtDNA Control Region and Phylogenetics of Five Sturgeons

WANG Wei ZHU Hua HU Hong-xia TIAN ZHAO-hui DONG Ying

WANG Wei, ZHU Hua, HU Hong-xia, TIAN ZHAO-hui, DONG Ying. Heteroplasmy in mtDNA Control Region and Phylogenetics of Five Sturgeons. Zoological Research, 2009, 30(5): 487-496. doi: 10.3724/SP.J.1141.2009.05487
Citation: WANG Wei, ZHU Hua, HU Hong-xia, TIAN ZHAO-hui, DONG Ying. Heteroplasmy in mtDNA Control Region and Phylogenetics of Five Sturgeons. Zoological Research, 2009, 30(5): 487-496. doi: 10.3724/SP.J.1141.2009.05487

五种鲟鱼线粒体控制区异质性和系统发育分析

doi: 10.3724/SP.J.1141.2009.05487
详细信息
    通讯作者:

    胡红霞

Heteroplasmy in mtDNA Control Region and Phylogenetics of Five Sturgeons

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    Corresponding author: HU Hong-xia
  • 摘要: 利用保守引物得到五种鲟鱼的线粒体DNA(mtDNA)控制区(D-loop)全长,长度在795~813 bp。序列中包括了CBS(conserved sequence block)和TAS(termination-associated sequence)区域。利用最大似然法、最大简约法和贝叶斯法构建了系统发育树,发育树分成两枝,呈现明显的生物地理分布。分析表明,现有的鳇属鱼类不是单系群起源。五种鲟鱼D-loop序列都存在长度和数目不等串联重复序列,长度在78~82 bp之间,重复序列拷贝数在4~6次不等,因此造成了mtDNA广泛的异质性现象。不同种类的重复序列单元十分相似,达氏鳇和史氏鲟重复序列单元相似度为82.93%,西伯利亚鲟和俄罗斯鲟重复序列单元相似度为90.59%。在串联重复序列后是一段不完全重复序列。通过与已有同种的重复序列比对发现不同鲟鱼重复序列相同,不同地理区域相同物种的重复序列可能发生过分子内重组。这些表明重复序列在鲟鱼进化上具有相关意义,推测重复序列可能产生在种分化前,重组发生在种分化后。
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出版历程
  • 收稿日期:  2009-04-03
  • 修回日期:  1900-01-01
  • 刊出日期:  2009-10-22

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