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Alternative splicing of an ATP-binding cassette transporter ABCC10 in Tetrahymena thermophila

LU Xing-Yi XIONG Jie YUAN Dong-Xia MIAO Wei

LU Xing-Yi, XIONG Jie, YUAN Dong-Xia, MIAO Wei. Alternative splicing of an ATP-binding cassette transporter ABCC10 in Tetrahymena thermophila. Zoological Research, 2011, 32(6): 605-610. doi: 10.3724/SP.J.1141.201106605
Citation: LU Xing-Yi, XIONG Jie, YUAN Dong-Xia, MIAO Wei. Alternative splicing of an ATP-binding cassette transporter ABCC10 in Tetrahymena thermophila. Zoological Research, 2011, 32(6): 605-610. doi: 10.3724/SP.J.1141.201106605

嗜热四膜虫腺苷三磷酸结合盒转运蛋白ABCC10基因的可变剪切分析

doi: 10.3724/SP.J.1141.201106605
基金项目: 武汉市学科带头人项目(201051730561)
详细信息
    作者简介:

    陆星亦

    通讯作者:

    缪 炜

  • 中图分类号: Q959.117; Q513

Alternative splicing of an ATP-binding cassette transporter ABCC10 in Tetrahymena thermophila

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    Author Bio:

    LU Xing-Yi

    Corresponding author: MIAO Wei
  • 摘要: 哺乳动物中腺苷三磷酸结合盒转运蛋白(ATP-bindingcassettetransporter,ABCT)可通过可变剪切产生多种转录本,其中含有提前终止密码子(prematureterminalcodon,PTC)的转录本还可与无义介导的mRNA降解通路(nonsense-mediatedmRNAdecay,NMD)作用来调节蛋白的相关功能,但这些现象尚未在低等生物的ABCT研究中发现。该文以单细胞原生动物——嗜热四膜虫为对象,利用转录组数据发现ABCC10基因存在可变剪切,并产生两条转录本(SV1和SV2),其中SV2在第五个内含子处发生内含子保留事件,这段长49bp的序列使SV2发生移码并产生PTC。在构建NMD通路中关键因子UPF1基因的嗜热四膜虫敲降株的基础上,利用实时荧光定量PCR方法检测SV2的转录情况。结果显示:含有PTC的转录本SV2在UPF1敲降株中的转录水平相对于野生型显著增加,说明SV2可被NMD通路降解。这与高等动物中某些ABCC蛋白通过可变剪切引入含PTC转录本,并能被NMD降解的方式一致,推测该方式在真核生物中十分保守,并在真核生物的共同祖先(thelasteukaryoticcommonancestor)中就已形成。
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出版历程
  • 收稿日期:  2011-10-24
  • 修回日期:  2011-11-14
  • 刊出日期:  2011-12-22

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