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Analysis of the complete mitochondrial genome sequence of Pielomastax zhengi

YANG Hui HUANG Yuan

YANG Hui, HUANG Yuan. Analysis of the complete mitochondrial genome sequence of Pielomastax zhengi. Zoological Research, 2011, 32(4): 353-362. doi: 10.3724/SP.J.1141.2011.04353
Citation: YANG Hui, HUANG Yuan. Analysis of the complete mitochondrial genome sequence of Pielomastax zhengi. Zoological Research, 2011, 32(4): 353-362. doi: 10.3724/SP.J.1141.2011.04353

郑氏比蜢线粒体基因组全序列的测定与分析

doi: 10.3724/SP.J.1141.2011.04353
基金项目: 自然基金资助项目(30670279;30970346)
详细信息
    作者简介:

    杨辉,硕士研究生,研究方向:基因组学

    通讯作者:

    黄 原

Analysis of the complete mitochondrial genome sequence of Pielomastax zhengi

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    Author Bio:

    YANG Hui

    Corresponding author: HUANG Yuan
  • 摘要: 采用长距PCR扩增及保守引物步移法测定并注释了郑氏比蜢(Pielomastaxzhengi)的线粒体基因组全序列。郑氏比蜢的线粒体基因组全长15602bp,A+T含量为71.8%,37个基因位置与飞蝗的一致,基因间隔序列共计10处47bp,间隔长度从1~20bp不等;有14对基因间存在52bp重叠,重叠碱基数在1~8bp之间。蛋白质基因的起始密码子均为昆虫典型的起始密码子ATN。ND5基因使用了不完全终止密码子T,其余基因均为典型的TAA或TAG。除tRNASer(AGN)的DHU臂缺失外,其余21个tRNA基因的二级结构均属典型的三叶草结构,但在郑氏比蜢中有5个tRNA(tRNACys、tRNALys、tRNAPhe、tRNAProtRNAArg)基因变异较大,无法采用常规算法预测出来,表现在这5个tRNA二级结构的TψC臂仅有3~4对配对碱基,tRNALys和tRNAArg的反密码臂仅有4对配对碱基。预测的lrRNA二级结构总共有6个结构域(结构域Ⅲ缺失),44个茎环结构。预测的srRNA的二级结构包含3个结构域,30个茎环结构。比较郑氏比蜢、西藏飞蝗(Locustamigratoriatibetensis)和疑钩额螽(Ruspoliadubia)rRNA二级结构后,发现郑氏比蜢与西藏飞蝗的更相似。A+T丰富区中存在一个被认为与复制及转录起始有关的Ploy(T)结构。
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出版历程
  • 收稿日期:  2011-01-06
  • 修回日期:  2011-03-28
  • 刊出日期:  2011-08-22

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