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Mitochondrial COI Gene Sequence Variation and Taxonomic Status of Three Macrobrachium Species

ZHANG Qing-yi CHENG Qi-qun GUAN Wei-bing

ZHANG Qing-yi, CHENG Qi-qun, GUAN Wei-bing. Mitochondrial COI Gene Sequence Variation and Taxonomic Status of Three Macrobrachium Species. Zoological Research, 2009, 30(6): 613-619. doi: 10.3724/SP.J.1141.2009.06613
Citation: ZHANG Qing-yi, CHENG Qi-qun, GUAN Wei-bing. Mitochondrial COI Gene Sequence Variation and Taxonomic Status of Three Macrobrachium Species. Zoological Research, 2009, 30(6): 613-619. doi: 10.3724/SP.J.1141.2009.06613

三种沼虾的COI基因序列变异及其分类地位探讨

doi: 10.3724/SP.J.1141.2009.06613
详细信息
    通讯作者:

    程起群

Mitochondrial COI Gene Sequence Variation and Taxonomic Status of Three Macrobrachium Species

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    Corresponding author: CHENG Qi-qun
  • 摘要: 罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)和日本沼虾(M. nipponense)已经在我国得到广泛的养殖,产生巨大的经济效益。祁连沼虾(M. qilianensis)是自然分布在我国甘肃省的土著虾种,因其外部形态符合沼虾属的特征,而被前人归入沼虾属。为了从分子生物学的角度理解罗氏沼虾、日本沼虾与祁连沼虾的遗传差异,为合理开发和利用沼虾资源提供理论基础,作者对这3种沼虾的线粒体COI基因序列进行研究。从甘肃、浙江等地分别采集这三种沼虾的样本各10尾,共30尾,其中祁连沼虾是野生样本,而罗氏沼虾和日本沼虾都是养殖样本。通过PCR方法扩增线粒体COI基因,并测序。通过比对,获得一致序列649 bp。在30个样本中共检测到169个变异位点,占总变异的26.04%;共检测到7种单倍型。 3种沼虾的核苷酸多态性分别为:罗氏沼虾0.411%、日本沼虾0.092%、祁连沼虾0.031%。野生的祁连沼虾遗传多样性远远低于养殖的罗氏沼虾和日本沼虾。三种沼虾单倍型之间的Kimura双参数遗传距离在19.87%~23.84%,三者之间的遗传距离较大,提示三者均为有效种。为进一步确定这三种沼虾在长臂虾科的分类地位, 我们从NCBI数据库中下载了长臂虾科的其它种类的COI序列进行系统发生分析。用NJ法构建的分子系统树显示:日本沼虾和罗氏沼虾与沼虾属的其它种类聚成一枝,而祁连沼虾与同亚科的脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)和长角长臂虾(Palaemon debilis)较沼虾属另10种虾的遗传距离近,即祁连沼虾与白虾属及长臂虾属聚成另一枝。因此,COI序列的结果不支持祁连沼虾归入沼虾属。但其分类地位应该综合多方面证据重新进行分析确定。
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出版历程
  • 收稿日期:  2009-05-19
  • 修回日期:  1900-01-01
  • 刊出日期:  2009-12-22

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