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Genetic Variation and Diversity of Phrynocephalus vlangalii hongyuanensis in Zoige Wetland Inferred from ND4-tRNAleu Gene

LIU Li GUO Xian-guang WANG Yue-zhao

LIU Li, GUO Xian-guang, WANG Yue-zhao. Genetic Variation and Diversity of Phrynocephalus vlangalii hongyuanensis in Zoige Wetland Inferred from ND4-tRNAleu Gene. Zoological Research, 2008, 29(2): 121-126. doi: 10.3724/SP.J.1141.2008.04353
Citation: LIU Li, GUO Xian-guang, WANG Yue-zhao. Genetic Variation and Diversity of Phrynocephalus vlangalii hongyuanensis in Zoige Wetland Inferred from ND4-tRNAleu Gene. Zoological Research, 2008, 29(2): 121-126. doi: 10.3724/SP.J.1141.2008.04353

若尔盖湿地青海沙蜥红原亚种线粒体ND4-tRNAleu基因的序列变异和遗传多样性

doi: 10.3724/SP.J.1141.2008.04353
详细信息
    通讯作者:

    王跃招

Genetic Variation and Diversity of Phrynocephalus vlangalii hongyuanensis in Zoige Wetland Inferred from ND4-tRNAleu Gene

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    Corresponding author: WANG Yue-zhao
  • 摘要: 研究了青海沙蜥红原亚种(Phrynocephalus vlangalii hongyuanensis)分布于四川若尔盖辖曼(XM)、红原(HY)和甘肃玛曲(MQ)这3个地理单元7个居群的ND4-tRNAleu基因的序列变异和遗传多样性。72个序列比对得到785 bp的片断,含变异位点7个,定义了9种单倍型。结果显示7个居群总的核苷酸多样性较低(0.00231±0.00016),单倍型多样性较高(0.806±0.024);就单个居群而言,MQa、MQb、XMb的遗传多样性低,XMc相对较高。各居群间的Kimura双参数遗传距离小(0.001—0.005),最大遗传距离出现在MQa和XMa之间,XM单元各居群之间遗传距离最小。但分子变异分析(AMOVA)显示3个单元间出现了显著差异(P<0.01),遗传变异主要存在于地理单元间,占62.61%。除MQ单元形成一支,单倍型网络图没有显示出单倍型和地理位置的对应关系,XM各居群以及HY混杂在一起。XM单元单倍型的不配对分布(Mismatch distribution)为明显左移的单峰,同时Fu’s Fs test得到负值(Fs=-2.21937),这都暗示XM单元可能经历了近期种群扩张,这是其单倍型多样性较高和核苷酸多样性较低的原因。MQ单元遗传多样性低而与其他单元显著分化,推测与黄河在若尔盖玛曲之间贯通有关。近期沼泽的形成对XMb的隔离时间短,使得其遗传多样性低但还不足以形成大的遗传差异。
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出版历程
  • 收稿日期:  2007-10-18
  • 修回日期:  1900-01-01
  • 刊出日期:  2008-04-22

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