线粒体基因组和7个核基因的系统发育分析揭示了条鳅科洞穴鱼类（间条鳅属，岭鳅属, 云南鳅属, 异条鳅属和洞鳅属）的系统发育关系

Phylogenetic relationships of Nemacheilidae cavefish (Heminoemacheilus, Oreonectes, Yunnanilus, Paranemachilus, and Troglonectes) revealed by analysis of mitochondrial genome and seven nuclear genes

摘要: 条鳅科的洞穴鳅类是中国西南喀斯特区域洞穴鱼类中最具多样化的类群之一。尽管一些物种已被纳入到先前的系统发育研究，但由于采样不足，中国条鳅科内洞穴鳅类的属间和种间关系仍未得到充分研究。该研究共收集了条鳅科洞穴鳅类的37个公认种和2个待定种的45个样本，占中国条鳅科洞穴鳅类8个有效属的87.5%。我们对线粒体基因组和7个核基因进行了测序，并分别重建了条鳅科洞穴鳅类的系统发育树。贝叶斯推断和最大似然分析都解决了在属和种水平的系统发育关系，这表明该多位点标记系统在确定中国洞穴泥鳅系统发育关系方面的有效性。系统发育分析结果不仅证实了以前传统上基于形态学数据提出的分类假说，并且对许多洞穴鳅类在属和种水平上的系统发育关系有了新的认识，也为目前条鳅科洞穴鳅类的分类提出了建议。