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Metagenomic comparison of the rectal microbiota between rhesus macaques (Macaca mulatta) and cynomolgus macaques (Macaca fascicularis)

Yan-Fang Cui Feng-Jie Wang Lei Yu Hua-Hu Ye Gui-Bo Yang

Yan-Fang Cui, Feng-Jie Wang, Lei Yu, Hua-Hu Ye, Gui-Bo Yang. Metagenomic comparison of the rectal microbiota between rhesus macaques (Macaca mulatta) and cynomolgus macaques (Macaca fascicularis). Zoological Research, 2019, 40(2): 89-93. doi: 10.24272/j.issn.2095-8137.2018.061
Citation: Yan-Fang Cui, Feng-Jie Wang, Lei Yu, Hua-Hu Ye, Gui-Bo Yang. Metagenomic comparison of the rectal microbiota between rhesus macaques (Macaca mulatta) and cynomolgus macaques (Macaca fascicularis). Zoological Research, 2019, 40(2): 89-93. doi: 10.24272/j.issn.2095-8137.2018.061

恒河猴和食蟹猴直肠微生物菌群的宏基因组比较

doi: 10.24272/j.issn.2095-8137.2018.061
基金项目:  
详细信息
    通讯作者:

    杨贵波,E-mail:guiboyang@chinaaids.cn

  • 中图分类号:  

Metagenomic comparison of the rectal microbiota between rhesus macaques (Macaca mulatta) and cynomolgus macaques (Macaca fascicularis)

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    Corresponding author: Gui-Bo Yang,E-mail:guiboyang@chinaaids.cn
  • 摘要: 恒河猴(Macaca mulatta)和食蟹猴(Macaca fascicularis)是建立人类疾病动物模型的常用动物。为确定这两种动物间肠道微生物菌群的差异,我们收集了20只恒河猴和21只食蟹猴的直肠拭子,通过16S rRNA基因深度测序对这些拭子中的微生物组成进行了检测。发现食蟹猴直肠微生物菌群的α多样性显著高于恒河猴,尽管观察到的微生物分类单元数(operational taxonomic units, OTUs)几乎相同。两种动物的优势微生物门和属相似,但优势微生物类群的相对丰度在两种动物之间显著不同。对微生物群落功能预测(Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States, PICRUSt)分析发现两种动物微生物菌群的功能成分,尤其是脂多糖(LPS)合成蛋白存在显著差异。上述数据表明这两种关系密切的猕猴属动物的肠道微生物菌群在组成和功能上都存在显著差异,需在疾病模型动物选择时予以考虑。
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出版历程
  • 刊出日期:  2019-03-18

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